Ștefan era mitropolitul ortodox al Sofiei în 1943. Un mitropolit conduce viața bisericească într-o regiune. Reprezentanții evreilor au căutat și sprijinul Bisericii împotriva persecuției. Acțiunile sale făceau parte dintr-o împotrivire mai amplă a persoanelor și comunităților; nu făceau protectoare întreaga politică a statului. S-a opus predării evreilor către germani. A apelat la țarul Boris III. A oferit refugiu în clădiri bisericești. Ajutorul Bisericii este documentat, dar nu șterge deportările din teritoriile ocupate.